MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. KJ006 chromosome 3

Total Repeats: 27242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017922	GAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905814
2	NC_017922	CG	3	6	253	258	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
3	NC_017922	CGC	2	6	264	269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
4	NC_017922	CGA	2	6	286	291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905814
5	NC_017922	GCCG	2	8	330	337	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
6	NC_017922	CGG	3	9	352	360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
7	NC_017922	GCG	2	6	423	428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
8	NC_017922	CGAC	2	8	447	454	25 %	0 %	25 %	50 %	387905814
9	NC_017922	CGC	2	6	463	468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
10	NC_017922	CG	3	6	473	478	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
11	NC_017922	GC	3	6	495	500	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
12	NC_017922	TGG	2	6	504	509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387905814
13	NC_017922	GAA	2	6	511	516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905814
14	NC_017922	GCC	2	6	548	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
15	NC_017922	CG	3	6	563	568	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
16	NC_017922	TCG	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
17	NC_017922	CGA	2	6	601	606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905814
18	NC_017922	GTC	2	6	623	628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
19	NC_017922	GCG	2	6	640	645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
20	NC_017922	GCC	3	9	686	694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
21	NC_017922	CG	4	8	712	719	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
22	NC_017922	CG	4	8	730	737	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
23	NC_017922	GGC	2	6	739	744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
24	NC_017922	CGC	2	6	882	887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
25	NC_017922	GCCG	2	8	889	896	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
26	NC_017922	GCT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
27	NC_017922	TCG	2	6	927	932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
28	NC_017922	TGC	2	6	1017	1022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
29	NC_017922	GC	3	6	1021	1026	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
30	NC_017922	GCT	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
31	NC_017922	GCT	2	6	1123	1128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
32	NC_017922	ACG	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905814
33	NC_017922	TGC	2	6	1152	1157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
34	NC_017922	GC	4	8	1175	1182	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
35	NC_017922	CGG	3	9	1189	1197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
36	NC_017922	GCC	3	9	1243	1251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
37	NC_017922	GC	3	6	1306	1311	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
38	NC_017922	CGGC	2	8	1365	1372	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
39	NC_017922	GCAT	2	8	1392	1399	25 %	25 %	25 %	25 %	387905814
40	NC_017922	CGCGC	2	10	1400	1409	0 %	0 %	40 %	60 %	387905814
41	NC_017922	GC	3	6	1443	1448	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
42	NC_017922	GCG	2	6	1483	1488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
43	NC_017922	CG	3	6	1487	1492	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
44	NC_017922	GTT	2	6	1528	1533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387905814
45	NC_017922	GC	3	6	1534	1539	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
46	NC_017922	CG	4	8	1582	1589	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
47	NC_017922	GCTGC	2	10	1598	1607	0 %	20 %	40 %	40 %	387905814
48	NC_017922	GCG	2	6	1608	1613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
49	NC_017922	CGG	2	6	1636	1641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
50	NC_017922	CG	5	10	1642	1651	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
51	NC_017922	GCCG	2	8	1681	1688	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
52	NC_017922	CG	3	6	1703	1708	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
53	NC_017922	CACGAC	2	12	1715	1726	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387905814
54	NC_017922	GCC	2	6	1745	1750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
55	NC_017922	GCC	2	6	1757	1762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
56	NC_017922	GC	3	6	1770	1775	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
57	NC_017922	GCC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
58	NC_017922	GC	3	6	1798	1803	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
59	NC_017922	CG	4	8	1827	1834	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
60	NC_017922	CGG	2	6	1849	1854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
61	NC_017922	GC	3	6	1879	1884	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
62	NC_017922	TGC	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
63	NC_017922	GAC	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905815
64	NC_017922	CGA	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905815
65	NC_017922	CG	3	6	2622	2627	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
66	NC_017922	CGCGGC	2	12	2635	2646	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
67	NC_017922	GCA	2	6	2727	2732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905815
68	NC_017922	TCCG	2	8	2784	2791	0 %	25 %	25 %	50 %	387905815
69	NC_017922	CGG	2	6	2794	2799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
70	NC_017922	GCT	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
71	NC_017922	TGC	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
72	NC_017922	GGCT	2	8	2918	2925	0 %	25 %	50 %	25 %	387905815
73	NC_017922	GCCG	2	8	2929	2936	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
74	NC_017922	TGC	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
75	NC_017922	CGG	2	6	2974	2979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
76	NC_017922	CGG	2	6	2986	2991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
77	NC_017922	CG	3	6	3025	3030	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
78	NC_017922	GC	3	6	3087	3092	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
79	NC_017922	GCT	3	9	3112	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
80	NC_017922	TCG	2	6	3165	3170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
81	NC_017922	GAA	2	6	3242	3247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905815
82	NC_017922	GCG	2	6	3256	3261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
83	NC_017922	GCC	2	6	3278	3283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905815
84	NC_017922	CGGC	2	8	3295	3302	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
85	NC_017922	GCT	4	12	3325	3336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
86	NC_017922	CGG	2	6	3337	3342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
87	NC_017922	TCG	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
88	NC_017922	CGT	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
89	NC_017922	TGC	2	6	3375	3380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
90	NC_017922	GCT	2	6	3448	3453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
91	NC_017922	GAT	2	6	3466	3471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905815
92	NC_017922	TGC	3	9	3474	3482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
93	NC_017922	GGCT	2	8	3491	3498	0 %	25 %	50 %	25 %	387905815
94	NC_017922	TGG	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387905815
95	NC_017922	TCG	2	6	3540	3545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
96	NC_017922	GTT	2	6	3547	3552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387905815
97	NC_017922	TGA	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905815
98	NC_017922	TCG	2	6	3606	3611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
99	NC_017922	CTG	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
100	NC_017922	CGG	2	6	3742	3747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
101	NC_017922	GAT	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905815
102	NC_017922	CTA	2	6	3808	3813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387905815
103	NC_017922	ATG	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905815
104	NC_017922	TCG	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
105	NC_017922	CGG	2	6	3852	3857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
106	NC_017922	CG	3	6	3867	3872	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
107	NC_017922	GCT	2	6	3873	3878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
108	NC_017922	GCG	2	6	3885	3890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
109	NC_017922	GAT	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905816
110	NC_017922	CGAAT	2	10	4240	4249	40 %	20 %	20 %	20 %	387905816
111	NC_017922	AAGG	2	8	4264	4271	50 %	0 %	50 %	0 %	387905816
112	NC_017922	CGAC	2	8	4289	4296	25 %	0 %	25 %	50 %	387905816
113	NC_017922	CGA	2	6	4452	4457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905816
114	NC_017922	TCGAC	2	10	4481	4490	20 %	20 %	20 %	40 %	387905816
115	NC_017922	CGTG	2	8	4494	4501	0 %	25 %	50 %	25 %	387905816
116	NC_017922	A	7	7	4527	4533	100 %	0 %	0 %	0 %	387905816
117	NC_017922	CG	3	6	4558	4563	0 %	0 %	50 %	50 %	387905816
118	NC_017922	GAC	2	6	4571	4576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905816
119	NC_017922	GCA	2	6	5177	5182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905817
120	NC_017922	GCT	2	6	5258	5263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905817
121	NC_017922	TGA	2	6	5281	5286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905817
122	NC_017922	CG	3	6	5295	5300	0 %	0 %	50 %	50 %	387905817
123	NC_017922	CGG	2	6	5320	5325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905817
124	NC_017922	GGC	2	6	5332	5337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905817
125	NC_017922	GGAC	2	8	5405	5412	25 %	0 %	50 %	25 %	387905817
126	NC_017922	TGCG	2	8	5437	5444	0 %	25 %	50 %	25 %	387905817
127	NC_017922	TGACGG	2	12	5503	5514	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387905817
128	NC_017922	GAT	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905817
129	NC_017922	GCG	2	6	5641	5646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905817
130	NC_017922	GCT	2	6	5663	5668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905817
131	NC_017922	AC	3	6	5694	5699	50 %	0 %	0 %	50 %	387905817
132	NC_017922	GAA	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905817
133	NC_017922	GCG	2	6	5738	5743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905817
134	NC_017922	TCG	3	9	5758	5766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905817
135	NC_017922	CAA	2	6	5774	5779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387905817
136	NC_017922	CAG	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905818
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260	NC_017922	CCGATC	2	12	11281	11292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387905821
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264	NC_017922	TCGG	2	8	11428	11435	0 %	25 %	50 %	25 %	387905821
265	NC_017922	CGC	2	6	11439	11444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905821
266	NC_017922	TCG	2	6	11455	11460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905821
267	NC_017922	ACC	2	6	11461	11466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387905821
268	NC_017922	GC	3	6	11524	11529	0 %	0 %	50 %	50 %	387905821
269	NC_017922	CGAAGC	2	12	11535	11546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905821
270	NC_017922	CGG	2	6	11553	11558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905821
271	NC_017922	CGT	2	6	11580	11585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905821
272	NC_017922	CCG	2	6	11687	11692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905821
273	NC_017922	GC	4	8	11772	11779	0 %	0 %	50 %	50 %	387905821
274	NC_017922	CGG	2	6	11786	11791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905821
275	NC_017922	GCG	2	6	11806	11811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905821
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277	NC_017922	CGG	2	6	11838	11843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905821
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280	NC_017922	GGCG	2	8	11871	11878	0 %	0 %	75 %	25 %	387905821
281	NC_017922	GGC	2	6	11880	11885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905821
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285	NC_017922	CGT	2	6	12195	12200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905822
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287	NC_017922	TCG	2	6	12257	12262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905822
288	NC_017922	CACG	2	8	12270	12277	25 %	0 %	25 %	50 %	387905822
289	NC_017922	GCAGC	2	10	12278	12287	20 %	0 %	40 %	40 %	387905822
290	NC_017922	CGG	2	6	12302	12307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905822
291	NC_017922	CGT	2	6	12335	12340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905822
292	NC_017922	GTCGAC	2	12	12355	12366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387905822
293	NC_017922	AGC	2	6	12367	12372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905822
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295	NC_017922	CG	3	6	12451	12456	0 %	0 %	50 %	50 %	387905822
296	NC_017922	CGG	2	6	12459	12464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905822
297	NC_017922	TCG	2	6	12473	12478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905822
298	NC_017922	GTCTCG	2	12	12506	12517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905822
299	NC_017922	TCG	2	6	12563	12568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905822
300	NC_017922	TGA	2	6	12883	12888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905823
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323	NC_017922	GTC	2	6	13627	13632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905823
324	NC_017922	CAG	2	6	13647	13652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905823
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373	NC_017922	CGA	2	6	16863	16868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905827
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381	NC_017922	CG	3	6	17067	17072	0 %	0 %	50 %	50 %	387905827
382	NC_017922	TCC	2	6	17089	17094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387905827
383	NC_017922	CCA	2	6	17114	17119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387905827
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387	NC_017922	CCT	2	6	17324	17329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387905827
388	NC_017922	GC	4	8	17371	17378	0 %	0 %	50 %	50 %	387905827
389	NC_017922	GCGAT	2	10	17380	17389	20 %	20 %	40 %	20 %	387905827
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391	NC_017922	CGCT	2	8	17451	17458	0 %	25 %	25 %	50 %	387905827
392	NC_017922	GT	3	6	17483	17488	0 %	50 %	50 %	0 %	387905827
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491	NC_017922	CG	3	6	26253	26258	0 %	0 %	50 %	50 %	387905833
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499	NC_017922	ACG	2	6	26731	26736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905833
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